O Programa de Iniciação Científica do CBPF é apoiado pelo Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). Durante os projetos de iniciação científica e tecnológica, os alunos são orientados e supervisionados por pesquisadores e tecnólogos do CBPF. Um número fixo de bolsas de estudo, destinadas a auxiliar despesas básicas de locomoção e alimentação, é concedido anualmente em base competitiva aos alunos inscritos. Os alunos inseridos no programa têm acesso à biblioteca e às instalações do CBPF. Podem ainda realizar experimentos em laboratórios, aprendendo e utilizando técnicas experimentais ou métodos teóricos nos seus estudos. Todas as áreas de pesquisa e desenvolvimento do CBPF são contempladas no Programa de IC. 

A esse programa podem candidatar-se alunos de graduação provenientes de cursos de Física e áreas afins. A chamada para novas bolsas é aberta anualmente no mês de Julho, sob a forma de edital disponível na página do Programa CBPF. Durante o ano, entre Setembro e Abril, novas inscrições são aceitas em modalidade de fluxo contínuo, e as bolsas disponíveis são concedidas mensalmente, em base competitiva. As inscrições são feitas online, por meio da página do Programa.

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